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研华携手伟萨科技发布一体化DNA基因排序加速解决方案
 

【CTIMES/SmartAuto Angelia 报导】   2019年05月14日 星期二

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全球知名的工业物联网解决方案提供商研华科技(2395.TW)近日宣布发布与伟萨科技技术共同创建的DNA基因排序加速解决方案。该解决方案解决了大中华区和北美地区对非侵入性产前检查(NIPT)和癌症和疾病诊断市场日益增长的需求。

基因排序加速解决方案
基因排序加速解决方案

“下一代测序(NGS)”是近年来备受关注的基因技术。通过比较和分析DNA序列,NGS根据人类基因组资料库精确定制治疗方案。NGS通过定位存储与潜在原因相关的资讯来?明医疗人员防止传播和感染,对抗癌症和罕见疾病。然而,产生了一个问题,基因服务提供者面临着越来越大的挑战:处理无休止的基因组资料。这个耗时耗力的过程阻碍了研究和进展。

为了应对这一挑战,研华科技与伟萨科技,一家专长在基因组测序加速的台湾公司,共同开发了一种加速解决方案。通过将研华SKY-7210伺服器与伟萨科技的FPGA卡相结合,专为精密医疗行业设计出一种优化和加速资料处理的基因排序一体式伺服器。

借助这个高速平台,种系变异分析管道处理时间最多可缩短25小时,从近33小时缩短到不足8小时,从而大大提高了效率并降低了TCO(总经营成本)。该基因排序速解决方案现在已经在研究机构、生物库、诊所和医院开始使用,在基因组资料分析方面提供了更大的灵活性,并提升了精确医学的价值。

基因排序加速解决方案提供一个无痛的升级过程,使用原生软体BWA-MEM和GATK处理种系变异分析的二次测序。使用者可以在不更改工作流的情况下完成对齐、排序、标记重复和变异检测的分析。随着本机快速演算法的加速,SNPs和INDELs的整体精度为99.9%,与原生软体相同。此外,加速解决方案提供与原生软体完全相同的输出档案格式。

基因排序加速解决方案为在伺服器上部署大资料和深度学习提供了一个平台,该服务器具有3TB DDR4??槽、3 x NMC(网路夹层卡)和2 x 300W GPU或6 x 150W GPU,以减少从HDD到FPGA的资料移动延迟。连接更灵活,更容易适应未来的扩展。

關鍵字: DNA基因排序  研华  伟萨  專用性伺服主機 
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